10 сентября 1875 года русские войска заняли город Ош, входивший в состав Кокандского ханства. Оно занимало огромную территорию, в связи с чем его завоевание завершилось лишь в следующем году. Такое решение проблемы было неизбежным, поскольку население среднеазиатской окраины Российской империи до 1876 года жило, как на пороховой бочке.
В январе 1876 года в Петербурге было принято решение о ликвидации независимости Кокандского ханства и о присоединении его к России. Оно было реализовано практически без потерь. 22 января Автобачи, понявший бессмысленность дальнейшего сопротивления, был арестован и отправлен в Россию. 4 февраля Скобелев без боя взял Коканд. Территория ханства была включена в состав Туркестанского генерал-губернаторства в качестве Ферганской области.
30 апреля 1918 года область стала частью Туркестанской АССР. 27 октября 1924 года в результате национально-территориального размежевания Ферганская область была разделена между Кара-Киргизской АО и Узбекской ССР. После выделения из территории Узбекской ССР Таджикской ССР в 1929 году, южная часть Ферганской области отошла последней.