Иван Иванович Масленников активно участвовал в Гражданской войне, начиная с 1918 года, где занимал различные должности в Красной Армии, включая начальника команды связи стрелкового полка и командира кавалерийской бригады. Он сражался в составе 9-й и 2-й Конных армий на Уральском, Донском и Воронежском фронтах против белогвардейцев, а также принимал участие в подавлении казачьих восстаний.
После Гражданской войны Масленников продолжил службу в Красной Армии, окончил Новочеркасские кавалерийские курсы усовершенствования командного состава и затем занимал ряд должностей, таких как начальник маневренной группы погранотряда в Туркестане, командир кавалерийского полка пограничных и внутренних войск НКВД.
С 29 июля по 1 августа 1953 года участвовал в переговорах, а затем в подавлении Воркутинского восстания.
Как вспоминал бывший заключённый А. А. Угримов, во время переговоров во 2-м лаг. отделении Речлага:
Кто-то крикнул из рядов рядом с нами: — Генерал! Вы нас бросили там в болотах в 41-м году, безоружных! Вы-то уцелели, а нам по двадцать пять дали!Надо отдать справедливость генералу — заключает Угримов — он всё выслушал спокойно…
В 1935 году Масленников окончил Военную академию им. М.В. Фрунзе и затем занимал руководящие должности в органах НКВД различных республик СССР. В ходе Великой Отечественной войны с декабря 1941 года он командовал 39-й армией на Западном и Калининском фронтах, где успешно руководил боевыми действиями, в том числе в Смоленском сражении и под Калинином.
За свои заслуги Масленников был награжден множеством орденов и медалей, включая орден Ленина и орден Красной Звезды. В июле 1945 года он был назначен заместителем главнокомандующего советскими войсками на Дальнем Востоке и принимал участие в планировании и руководстве операциями по разгрому японской Квантунской армии.
После ареста и расстрела Берии и некоторых его приближённых, Масленникова вызвали на допрос, расспрашивая про планы введения войск в Москву для захвата власти. Масленников отнекивался, но всё понимал, что вскоре придёт его черед, поэтому он выбрал смерть от собственного пистолета, чем суд, лишение всех званий и расстрел. 16 апреля 1954 года Иван Масленников застрелился в собственном кабинете.
16 апреля 1954 года Масленников покончил жизнь самоубийством. Похоронен на Ваганьковском кладбище (участок 20).