Предпосылкой создания ВАО АЭС явилась авария на Чернобыльской АЭС в 1986 году. Помимо непосредственных последствий авария получила отголосок во всей ядерной энергетике в целом.
Она вынудила операторов переоценить проблему безопасности АЭС и задуматься о необходимости международного сотрудничества. Ядерная авария в любом регионе может иметь последствия и для других стран; поэтому все операторы атомных станций несут коллективную ответственность за обеспечение надежности и безопасности их эксплуатации.
ВАО АЭС была создана после Чернобыльской аварии операторами АЭС всего мира, которые стремились сделать все возможное, чтобы предотвратить повторение подобной аварии. Официальное образование ВАО АЭС было провозглашено на учредительной ассамблее 15 мая 1989 года в Москве.