С завершением войн с Наполеоном Александру I требуется надежный и эффективный руководитель военного ведомства. Чудовищно возросшие военные расходы не могли не сказаться на состоянии казны. Император не ошибся в выборе, уже первый год управления министерством, принес результаты, за которые Пётр Петрович был представлен к ордену Александра Невского с алмазными знаками..
В 1819 году Коновницын из-за резко ухудшившегося здоровья просит отставки. Александр прошение удовлетворяет и отправляет средства на лечение в минеральных водах. Вернувшись с лечения, личным указом императора, Коновницын назначен руководить кадетскими корпусами. Однако здоровье его продолжает ухудшаться. 22 августа 1822 года Петр Петрович Коновницын умер. На отпевании присутствовали первые лица государства, в числе которых был и будущий император Николай I.