Поводом к такому решение послужили вооруженные столкновения между армянами и азербайджанцами, претендовавшими на территорию области.
Конфликт имеет глубокие исторические корни и в годы перестройки перешел в стадию открытого противостояния.
Конфликт за формально находившуюся в составе Азербайджана область для советского руководства был крайне неудобен, поэтому никаких серьезных шагов по его урегулированию не предпринималось.
Один из занимавшихся тогда конфликтом политиков Галина Старовойтова объясняла это так: «Советское руководство совершенно обоснованно опасалось, что одобрение такого изменения может привести к неуправляемому развалу Советского государства.
Вдобавок к этому, национально-демократическое движение Армении имело заметную антикоммунистическую окраску, что едва ли способствовало склонению Москвы к удовлетворению этих требований».
В январе 1990 года в Нагорном Карабахе начались столкновения с применением артиллерии и бронетехники, в Баку произошли армянские погромы жертвами которых стали до 90 человек.
В такой ситуации 3 апреля был принят закон «О правовом режиме чрезвычайного положения», который и был впервые применен в Нагорном Карабахе.
Однако режим ЧП существенно не повлиял на развитие ситуации, и военные действия в регионе были продолжены.
Апогея конфликт достиг в 1991 году, который был отмечен, например, 120-суточным практически беспрерывным обстрелом города Степанакерт.
Соглашение о прекращении огня и урегулировании конфликта было подписано 5 мая 1994 года в Бишкеке при посредничестве России и Киргизии.
С армянской стороны в результате конфликта погибло 4500-6000 человек.
Точных данных о потерях азербайджанской стороны нет, разные источники называют цифры в 25000-30000 человек.
По данным Международного Красного Креста, в период войны в Нагорном Карабахе стороны потеряли по общим оценкам до 45 000 человек.
При этом потери армянской стороны оцениваются в 17 000 человек, а Азербайджанские в 25 000.
Учитывая крайне значительное расхождение в цифрах потерь с армянской стороны, можно предположить, что в эту цифру были внесены и раненные в ходе боевых действий.
Первый обмен пленными состоялся в мае 1995 года, через год после прекращения огня.
Около 90 человек власти Нагорного Карабаха отказались возвращать, требуя от Азербайджана передачи не только пленных и заложников, но и 30 армян, отбывавших наказание и находящихся под следствием в Азербайджане.