Эдуард Володарский родился 3 февраля 1941 года в Харькове. Его родители, Яков Исаакович Володарский и Мария Яковлевна Бригова, придерживались разных национальностей и культур. Отец, еврей, якобы погиб на фронте во время Великой Отечественной войны, но по официальным данным был награжден орденом Отечественной войны 2-й степени в 1985 году. Мать, русская, была оперуполномоченной районного НКВД и вместе с сыном была эвакуирована в Актюбинск в начале войны.
После возвращения в Харьков в 1944 году семья Володарского осела в Москве, где его матери вышла замуж за подполковника НКВД. В детстве его крестили в храме на Ордынке под именем Фёдор, а позже он провел несколько лет в деревне у тёти, прежде чем вернуться в Москву.
Уже в школьные годы Володарский начал писать стихи и рассказы. Он также проводил много времени на улице с хулиганами и даже несколько месяцев отсидел в тюрьме, что стало основой для его автобиографичного сценария «Прощай, шпана замоскворецкая…».
После неудачной попытки поступления на Геологический факультет МГУ он уехал на Север в составе геологоразведочной экспедиции и работал буровиком в различных местах. Одновременно он продолжал писать и рассылать свои работы по издательствам. Его карьера сценариста началась с фильма «Шестое лето» в 1967 году, а в 1974 году он совместно с Никитой Михалковым создал фильм «Свой среди чужих, чужой среди своих» по мотивам его повести.
Впоследствии он написал множество пьес и сценариев, многие из которых были успешно экранизированы. Среди его работ — «Проверки на дорогах», «Долги наши», «Уходя, оглянись» и другие. В 1980-е годы Володарский активно занимался писательской деятельностью, создавая разнообразные произведения, включая биографические повести о исторических личностях.
Он также читал лекции и был членом Союза писателей СССР и Союза кинематографистов России. Эдуард Володарский скончался 8 октября 2012 года в Москве и был похоронен на Ваганьковском кладбище.