Рогинский Сергей Васильевич призван в Красную Армию в феврале 1920 года и начало свою военную службу в составе 7-го запасного стрелкового полка Московского военного округа. Участвуя в Гражданской войне, оно служило в составе 65-го стрелкового полка 8-й стрелковой дивизии, где принимало участие в боях на Западном фронте против белополяков.
После окончания военно-инженерных курсов в августе 1921 года, этот человек был направлен на Туркестанский фронт, где стал командиром взвода 5-го инженерного батальона. С марта 1922 года, на том же фронте, он возглавил полуэскадрон в 8-й кавалерийской бригаде, а затем с октября командовал взводом в 13-м сапёрном батальоне. В составе этих частей он участвовал в борьбе с басмачами.
В послевоенный период, начиная с мая 1923 года, этот человек служил в 14-й стрелковой дивизии Московского военного округа. Он занимал должность командира учебного взвода и помощника командира отдельной сапёрной роты. С августа 1928 года по май 1929 года, он управлял сапёрным обучением во 2-м стрелковом полку Московской Пролетарской стрелковой дивизии, после чего вернулся в 14-ю стрелковую дивизию, где возглавил отдельную сапёрную роту. После окончания Военно-инженерной академии РККА в мае 1934 года, он был назначен командиром отдельного батальона 4-й отдельной механизированной бригады Белорусского военного округа.
После окончания Академии Генштаба РККА в августе 1939 года, этот человек стал начальником 1-го отделения 9-го отдела в Генштабе РККА. С февраля 1940 года он возглавил 1-е отделение отдела укреплённых районов Генштаба РККА.
В начале Великой Отечественной войны, начиная с июня 1941 года, он стал помощником начальника оперативного управления штаба Северо-Западного фронта. В июле того же года он возглавил 111-ю стрелковую дивизию 41-го стрелкового корпуса 11-й армии этого же фронта. Под его командованием дивизия отступала от Пскова к предполью лужской оборонительной полосы, где смогла остановить продвижение противника. В течение июля-августа, в составе 41-го стрелкового корпуса Лужской оперативной группы Северного фронта, дивизия обороняла позиции юго-западнее города Луга. В сентябре дивизия была окружена. В начале октября, уничтожив материальную часть, она вышла из окружения и до середины ноября находилась в резерве. Затем дивизия вошла в состав 52-й армии Волховского фронта и участвовала в Тихвинских оборонительной и наступательной операциях.
В апреле 1942 года, этот человек был назначен командиром 6-го гвардейского стрелкового корпуса 8-й армии Группы войск волховского направления Ленинградского фронта, и в мае было ему присвоено звание генерал-майора. В июне армия вошла в состав вновь созданного Волховского фронта.
В августе и сентябре этот корпус и его части действовали в составе фронтовой ударной группировки в Синявинской наступательной операции, цель которой заключалась в прорыве блокады Ленинграда. Несмотря на неудачу в достижении основной цели, советским войскам удалось нанести значительные потери врагу и сорвать его планы на новое наступление на Ленинград.
В декабре 1942 года, он был назначен заместителем командующего войсками 2-й ударной армии Волховского фронта. В январе 1943 года этот фронт участвовал в операции «Искра», направленной на прорыв блокады Ленинграда. С марта того же года Рогинский стал командовать 54-й армией Волховского фронта, чьи войска принимали участие в ликвидации «Киришского выступа» в системе обороны врага. Звание генерал-лейтенанта было присвоено ему в сентябре 1943 года.
В январе и феврале 1944 года части 54-й армии в составе Волховского, а затем Ленинградского фронтов участвовали в Ленинградско-Новгородской наступательной операции, действуя на любанском и островском направлениях. В конце апреля эта армия была передана 3-му Прибалтийскому фронту, где принимала участие в Псковско-Островской и Рижской наступательных операциях. С февраля 1945 года он командовал 67-й армией Ленинградского фронта, чьи войска до конца войны осуществляли оборону и охрану побережья Рижского залива.
После войны генерал-лейтенант С.В. Рогинский с мая 1945 года командовал 95-м стрелковым корпусом в составе 4-го Украинского фронта. С августа того же года он занял должность начальника штаба 52-й армии Львовского военного округа, а с июня 1946 года — в 13-й армии в Прикарпатском военном округе. С января 1947 года он стал начальником штаба и первым заместителем командующего войсками Ленинградского военного округа.
После окончания Военной академии им. К.Е. Ворошилова в июле 1951 года он был назначен начальником штаба и первым заместителем начальника инженерных войск Советской Армии. С апреля 1954 года находился в отставке.
Был награжден орденом Ленина, двумя орденами Красного Знамени, орденами Кутузова 1-й степени, Богдана Хмельницкого 1-й степени, а также медалями.

Похоронен на Новодевичьем кладбище в Москве.