В ночь с 6 на 7 октября 1941 года, только что сформированный полк Московского командного училища имени Верховного Совета РСФСР, был поднят по тревоге. Осуществив за 36 часов под проливным дождем 85-километровый марш-бросок, курсанты заняли свои позиции вдоль берега реки Лама, выделенные им для обороны. В течение двух месяцев, несмотря на тяжелейшие потери и постоянные атаки немецких войск, полк героически сдерживал наступление противника в направлении Москвы, нанося фашистам значительные потери.
К октябрю 1941 года для советских войск, защищавших Москву, сложилась чрезвычайно сложная ситуация. Немецкая армия стремительно продвигалась к столице, сосредотачивая огромные силы на основных направлениях наступления. На Московском направлении действовала немецкая группа армий «Центр,» которая включала в себя 78 дивизий и общее число военнослужащих превышало 1,9 миллиона, включая около 2 тысяч танков и множество артиллерийских и минометных орудий, а также 780 самолетов.
Для обороны Москвы, Сталин сосредоточил все доступные силы нескольких фронтов. Только Западный, Резервный и Брянский фронты насчитывали около 1,25 миллиона человек. Практически все доступные силы были брошены на оборону столицы, включая гражданское население, которое было мобилизовано для укрепления обороны.
Тем временем, немецкие войска стремительно приближались к Москве. 3 октября они захватили Орел, 6 октября — Брянск и Карачев. Трое советских армий — 3-я, 13-я и 50-я — оказались окруженными под Брянском, а командовавший Брянским фронтом генерал-полковник Андрей Еременко был серьезно ранен и эвакуирован в Москву.
Ситуация также ухудшилась в районе Вязьмы, где 37 дивизий, 9 танковых бригад, 31 артиллерийский полк и командиры нескольких армий оказались окруженными. Более 688 тысяч советских солдат и офицеров были взяты в плен, включая командующего 19-й армией генерал-лейтенанта Михаила Лукина и бывшего командующего 32-й армией генерал-майора Сергея Вишневского. Генерал-майор Константин Ракутин, командующий 24-й армией, погиб. Только 85 000 бойцов смогли выбраться из окружения.
Сил для обороны Москвы становилось всё меньше, и в резерве оставались только курсанты военных училищ Московской области. По решению Верховного Главнокомандования 6 октября 1941 года был сформирован отдельный кремлевский полк, состоящий из 1 330 курсантов, 130 красноармейцев и 112 офицеров училища. Под командованием начальника училища и Героя Советского Союза полковника Семена Младенцева, полк приступил к обороне Москвы.
Во время обороны, курсанты полка проявили большое мужество и отвагу, нанеся фашистам значительные потери. За свой героический подвиг, 59 курсантов и 30 офицеров были награждены орденами и медалями. Потери полка составили 811 человек. По окончании задачи по обороне Москвы, отдельный кремлевский полк был расформирован.
Училище вернулось в Москву 28 января 1942 года. Во время Великой Отечественной войны, училище выпустило 19 курсов и подготовило более 24 000 командиров.