10 июня 2005 — решением Священного Синода Русской Православной Церкви в Хабаровске создана духовная семинария — высшее учебное заведение Московского Патриархата для подготовки священнослужителей.
До революции 1917 года на Дальнем Востоке было несколько средних духовных учебных заведений (до недавнего времени духовная семинария считалась средним учебным заведением для подготовки духовенства) — учреждённых в середине XIX века святителем Иннокентием, митрополитом Московским и Коломенским, апостолом Дальнего Востока и Северной Америки, тогда — епископом (впоследствии — архиепископом) Камчатским, Курильским и Алеутским, и его преемниками, Новоархангельская духовная семинария в Ново-Архангельске (на о-ве Ситха из числа Алеутских островов, 1840 год) и Якутске (переведена из Ново-Архангельска, 1858 год), духовное училище (1862 год) и Благовещенская духовная семинария (1871 год) в Благовещенске.
Эти учебные заведения стали вскоре центрами как религиозного, так и культурного просвещения огромной малонаселённой территории. В семинариях в обязательном порядке изучались языки местных народностей, а также языки народов сопредельных государств — Японии, Кореи и Китая. В эти учебные заведения отправлялись за казенный счёт наиболее талантливые дети из семей коренных народов Дальнего Востока. Основным направлением работы было миссионерство; активно переводились на местные языки Священное Писание, богослужебные и вероучительные книги. Помимо чисто богословских и богослужебных выпускникам также прививались знания по медицине, агрономии. По официальной статистике до 80 % учительских кадров Приамурья были выходцами из Якутской и Благовещенской духовных школ.
После революции 1917 года на Дальнем Востоке были закрыты все духовные учебные заведения.
