11 сентября 1855 г. в Петербурге, на базе офицерских классов Михайловского артиллерийского училища, была создана Михайловская артиллерийская академия.
Первоначально Михайловская артиллерийская академия входила в состав Императорской военной академии, а в 1863 г. получила самостоятельность. Академия имела 3 класса: младший, старший и дополнительный. Первые два класса готовили офицеров к занятию должности командира батареи и выше, третий — к службе на артиллерийских заводах и в научных учреждениях артиллерийского ведомства.
Академия имела свою библиотеку, химическую лабораторию, музей и физический кабинет. Число обучающихся во всех трёх классах составляло 60 офицеров. К приёмному экзамену допускались офицеры всех родов войск до чина поручика гвардии или штабс-капитана армии включительно, если они прослужили в офицерском звании не менее 3-ёх лет, в том числе в строевых частях — не менее 2 лет. От поступающих, окончивших артиллерийское училище или физико-математический факультет университета, требовалась лишь двухлетняя служба.
Учёные, конструкторы и воспитанники академии внесли большой вклад в развитие артиллерии, стрелкового оружия и артиллерийской науки. Русские артиллеристы первыми в мире разработали методы стрельбы с закрытых огневых позиций и применили их на практике в русско-японской войне. Среди выпускников академии разных лет много известных командиров-артиллеристов, прославленных учёных и конструкторов (создатель трёхлинейки С. И. Мосин, конструктор орудий В. Г. Грабин, лётчик П. Н Нестеров и др.).
В 1919 г. Михайловская артиллерийская академия была переименована в Артиллерийскую академию РККА. В 1932 г. артиллерийский факультет этой академии был выделен в самостоятельную Артиллерийскую академию (с 1934 г. им. Ф. Э. Дзержинского), которая в 1938 г. была переведена в г. Москву.
В 1953 г. из состава академии были выведены командные факультеты и возвращены в Ленинград, где на прежней базе Михайловской артиллерийской академии была образована Военная артиллерийская командная академия (с 1960 г. — Военная артиллерийская академия имени Калинина).
В сентябре 1998 г. академия была реорганизована в Михайловский военный артиллерийский университет, в структуру которого вошли также три филиала (Казанский, Коломенский и Саратовский — бывшие артиллерийские училища).
9 июля 2004 г. Михайловский военный артиллерийский университет преобразован в Михайловскую военную артиллерийскую академию. Вместо филиалов созданы Казанское высшее артиллерийское командное училище (военный институт) имени маршала артиллерии М. Н. Чистякова и Коломенское высшее артиллерийское командное училище (военный институт).
